Hola Antonio,
Los aminoácidos que no sintetiza nuestro organismo se llaman aminoácidos esenciales. Están presentes en los alimentos de origen animal (el huevo es el alimento de la dieta humana más completo en éste aspecto), por lo que si tomas éstos alimentos, no tienes de qué preocuparte. Es más, también hay formas de obtener los aminoácidos esenciales que necesitamos en el caso de personas vegetarianas (Ej: combinación de legumbres + cereales o proteínas de frutos secos).
Los suplementos proteicos típicos de gimnasio podrían estar incluidos en una dieta saludable en pequeña cantidad y según el caso: Sin embargo, en la mayoría de casos no son necesarios, por lo que mi consejo es que bases tu alimentación en ingredientes lo más próximos posible a las materias primas (verduras, frutas, carne y pescado, huevos, frutos secos, legumbres, cereales...).
Uno de los productos más demandados en los gimnasios en cuanto a aminoácidos se trata de los aminoácido de cadena ramificada (probablemente se trata de las pastillas o batidos de los que hablas). La investigación científica sobre su utilidad par mejorar el rendimiento deportivo es limitada en la actualidad, por lo que de nuevo mi consejo es que optes por alimentos sencillos.